HMMER2.0 [2.3.2] NAME confirmedSignalSeqs LENG 45 ALPH Amino RF no CS no MAP yes COM /usr/local/tools/bin/hmmbuild -g --archpri 0.95 --amino sig.hmm confirmedSignalSeqs.align COM /usr/local/tools/bin/hmmcalibrate sig.hmm NSEQ 252 DATE Tue Jul 6 11:43:05 2004 CKSUM 5425 XT -8455 -4 0 * -8455 -4 * 0 NULT -4 -8455 NULE 595 -1558 85 338 -294 453 -1158 197 249 902 -1085 -142 -21 -313 45 531 201 384 -1998 -644 EVD -9.936908 0.345496 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y m->m m->i m->d i->m i->i d->m d->d b->m m->e -6 * -7864 1 -10952 -9758 -10784 -11170 -11232 -9741 -10404 -12286 -11342 -11607 5400 -11088 -3461 -11215 -10762 -11422 -11195 -11903 -9997 -11249 1 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -214 -13026 -2863 -894 -1115 -701 -1378 -6 * 2 1315 -6255 -514 -106 -1628 772 -1400 -1419 643 -842 -249 -1032 -828 458 1375 -794 -939 -326 63 -1046 2 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -275 -12813 -2526 -894 -1115 -5210 -40 * * 3 -630 779 -2818 -1989 -1677 496 -99 -6004 -341 11 -1051 -2380 1391 -20 1675 836 518 -1229 743 -1328 3 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -160 -12538 -3258 -894 -1115 -6240 -19 * * 4 662 -669 -1274 -1849 -1603 765 481 -2022 158 -281 -827 -1566 1405 -1081 1463 264 251 -1790 -218 -2211 4 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -158 -12378 -3272 -894 -1115 -6566 -15 * * 5 5 1506 -4160 -438 -1536 841 -102 -5495 -277 -562 -634 -2141 1467 -1248 1466 631 -418 -543 1159 -2327 5 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -188 -12221 -3037 -894 -1115 -6804 -13 * * 6 275 1470 -265 -2236 -2024 312 -569 -5551 -150 119 369 -1478 1045 -1139 1785 160 357 -3071 220 -948 6 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -337 -12034 -2264 -894 -1115 -7019 -11 * * 7 -334 2318 -2180 -3181 -920 593 44 -4833 -720 97 1402 -1610 1195 -861 1003 674 624 -1700 -5191 -1548 7 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -341 -11697 -2250 -894 -1115 -7291 -9 * * 8 385 551 -859 -497 -97 727 -785 -1763 -832 -789 220 -3062 1531 -547 1732 176 -1006 -4377 838 -429 8 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -220 -11357 -2828 -894 -1115 -7477 -8 * * 9 716 1157 -3626 -705 -353 256 -464 -3676 -572 559 -627 -3285 1031 377 758 195 -747 245 79 -1051 9 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -318 -11138 -2339 -894 -1115 -7566 -8 * * 10 -436 0 -946 -1017 -1220 448 873 -4359 -257 117 -3428 -2552 1231 -2117 2241 60 413 -1152 -4531 -3865 10 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -354 -10821 -2203 -894 -1115 -7667 -7 * * 11 -234 1406 -2625 -2074 -4004 1087 -2339 -3679 396 260 -2918 -505 512 291 1073 752 -903 -709 1590 -228 11 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -363 -10468 -2172 -894 -1115 -7751 -7 * * 12 -880 1672 -2556 -2002 -3319 -313 1260 -2941 -580 883 268 376 591 -1826 1215 858 -539 -2710 1953 -286 12 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -403 -10107 -2041 -894 -1115 -7814 -6 * * 13 -592 2365 -2384 -1828 -2803 106 -1910 -2405 389 1173 -1882 -2040 454 307 1357 -693 -366 -515 1763 -2576 13 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -467 -9706 -1861 -894 -1115 -7866 -6 * * 14 -329 1424 -1785 -1231 -2767 221 1125 -2405 -1116 370 -1759 -1489 1986 577 1802 -1672 -66 -2145 -2918 -2363 14 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -172 -9243 -3174 -894 -1115 -7910 -6 * * 15 -1495 1436 159 1434 -3150 1303 1054 -2873 -744 141 -1969 -1136 -2576 -701 1178 -28 -1434 -2470 1836 -2419 15 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1094 -9075 -916 -894 -1115 -7922 -6 * * 16 -1304 -2101 -1474 -1063 -2563 1527 -1144 -2181 1155 354 -1560 -1218 2510 -808 -866 -1354 -1321 -1888 -2633 -2162 16 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -663 -7989 -1456 -894 -1115 -7973 -6 * * 17 -961 -2502 1711 1573 -2798 1057 -492 -2574 -214 -2508 -1635 -224 -1854 -70 1626 -788 -928 -2118 -2683 -1942 17 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -2503 -7339 -291 -894 -1115 -6358 -18 * * 18 -2145 -1838 -3463 -3274 -553 -3182 -2429 -4 -2860 2951 403 -3110 -3206 -2559 -2712 -2893 -2150 -496 -1842 -1570 18 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -22 -6615 -7657 -894 -1115 -7037 -11 * * 19 -780 -1278 -1638 -1366 -1586 1761 -1222 -1679 -1221 -1884 -1192 -1288 2160 -1158 -1453 -975 -951 -1359 3948 -1359 19 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -17 -7008 -8051 -894 -1115 -5580 -30 * * 20 1624 2507 -3025 -2461 -1082 433 -1522 -596 -2149 494 -314 -2064 954 -1848 -2098 -1498 -1003 990 -1568 -1219 20 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -8 -8072 -9114 -894 -1115 -4703 -56 * * 21 1167 1617 -4022 -3388 -1483 -346 -2115 -1021 -2988 1620 2364 -2883 118 -2615 -2796 -2327 -1640 345 2044 -1645 21 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -4 -9100 -10142 -894 -1115 -3496 -134 * * 22 1804 459 -4968 -4334 -2448 -205 -3074 -586 -3938 1411 503 -694 112 -3568 -3752 587 -2601 634 -2950 -2607 22 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -2 -10242 -11284 -894 -1115 -3447 -139 * * 23 1166 -86 -5548 -4912 620 -1008 -3624 -227 -4507 974 839 -1027 1130 -1615 -4309 378 -3146 1149 1713 -3148 23 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -10843 -11885 -894 -1115 -3728 -113 * * 24 1449 762 -5852 -5216 234 -1353 111 232 -4811 1359 -363 -4700 871 -1271 -4611 365 -756 -250 1162 -1047 24 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11167 -12209 -894 -1115 -2469 -287 * * 25 1326 688 -6373 -5737 -308 -771 -137 446 -5333 1646 804 -2131 -2476 -1004 -5133 -727 65 2 2331 -3972 25 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11718 -12760 -894 -1115 -2040 -402 * * 26 1298 -476 -6796 -6160 489 -1157 -537 -108 -5754 1726 -421 -5644 -828 -5377 -5554 -243 -1656 1240 1203 -453 26 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12154 -13196 -894 -1115 -2028 -406 * * 27 837 1529 -7049 -6413 358 -828 -194 -2620 -6008 1818 -3734 -5897 251 -1574 -5808 60 -230 952 1581 -4647 27 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12416 -13458 -894 -1115 -1575 -590 * * 28 782 230 -7276 -6640 746 -436 -905 -613 -6234 2033 -1605 -6124 -916 -1298 -6034 -693 -2810 394 2835 -829 28 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12647 -13689 -894 -1115 -1697 -532 * * 29 622 696 -7397 -6761 652 -363 -5470 -390 -6356 2046 75 -2840 -368 -2730 -6156 -629 -1110 554 2288 -4994 29 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12772 -13814 -894 -1115 -1286 -761 * * 30 294 1729 -7503 -6867 -499 -1435 -1133 -519 -6461 2145 -118 -2946 -205 -2070 -6261 -702 -404 859 1819 -5099 30 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12879 -13921 -894 -1115 -654 -1457 * * 31 246 1025 -7596 -6960 1005 -403 -2164 -171 -6555 2374 -1097 -6444 -1234 -2023 -6355 -1784 -1034 255 1053 -2730 31 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12974 -14016 -894 -1115 -87 -4090 * * 32 113 -44 -7645 -3860 478 -471 -2234 -193 -6604 2340 390 -3060 -625 -2359 -3608 -375 -1063 -24 943 -1562 32 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 33 579 826 -7647 -7010 -164 -303 -1413 -195 -6605 2252 -926 -3160 -973 -2245 -6405 -629 -2044 554 2037 -5243 33 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 34 231 1226 -7646 -2917 311 -338 -1329 -391 -6605 2193 607 -6494 -1523 -2341 -6405 -303 -297 496 -525 -1748 34 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 35 603 1423 -3546 -3811 796 -794 -2394 -690 -3489 2014 420 -3319 -358 -1379 -3407 -880 -753 598 1030 -2556 35 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 36 1520 -7709 -10641 -10040 1210 -10315 -9001 -324 -9805 2361 448 -10021 -9498 -8670 -9327 -9616 -8113 512 1563 -7867 36 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 37 1177 -7764 -10709 -10105 858 -10406 -9068 -961 -9876 2481 1028 -10117 -9540 -8701 -9379 -9722 -8178 623 2131 -7904 37 - -154 -445 230 40 -386 404 111 -628 205 -463 -726 270 394 44 91 364 119 -371 -300 -243 - -3622 -3307 -290 -648 -1467 -701 -1378 * * 38 -321 2261 -4351 -3764 -554 -172 1548 452 -3526 553 -2128 -978 -246 1731 -370 804 -185 -1152 -3370 -326 42 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -10570 -11613 -894 -1115 -2686 -244 * * 39 -507 2277 -3219 -438 -5161 1385 302 -4911 -293 -76 -3931 -122 978 279 157 596 663 -1943 -5025 -4343 43 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11320 -12362 -894 -1115 -2246 -341 * * 40 -439 2899 -1542 -2077 -1849 226 -3952 -1257 -2308 575 -981 -1256 1654 -1824 -463 524 563 -270 -4917 266 44 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11874 -12916 -894 -1115 -810 -1219 * * 41 -1534 1075 -1044 -1031 -2814 1197 597 -3184 -476 -1117 -2212 -1698 1655 1002 54 1068 567 -2044 -1007 -319 45 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12636 -13679 -894 -1115 -1170 -848 * * 42 -731 1141 -1383 -828 -1044 1140 -618 -2112 -1123 341 -1226 -1992 1735 476 36 627 -1911 -61 639 -1227 46 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12821 -13863 -894 -1115 -25 -5837 * * 43 1601 783 -7642 -7006 -2211 503 -2577 -329 -3693 -985 -4331 -2089 -3837 -6226 -6404 1228 997 1814 -5585 -3044 47 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 44 610 203 -142 -92 -1028 -325 682 -1685 -980 813 -1366 -2963 -2137 983 1120 25 -30 -1744 1385 142 48 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13026 -14068 -894 -1115 -701 -1378 * * 45 2533 18 -3484 -2551 -8410 1997 -6667 -8184 -6479 -4206 -7342 -6336 -67 -478 -6895 1040 -1226 -7368 -8436 -7924 49 - * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * - * * * * * * * * 0 //