HMMER2.0 [2.2g] NAME hum.sig.fa LENG 46 ALPH Amino RF no CS no MAP yes COM /usr/local/seq/libexec/hmmbuild -g --archpri 0.95 --amino hsig95.hm hum.sig.fa.align COM /usr/local/seq/libexec/hmmcalibrate hsig95.hm NSEQ 351 DATE Sun Jun 2 15:01:18 2002 CKSUM 7851 XT -8455 -4 0 * -8455 -4 * 0 NULT -4 -8455 NULE 595 -1558 85 338 -294 453 -1158 197 249 902 -1085 -142 -21 -313 45 531 201 384 -1998 -644 EVD -10.894680 0.304448 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y m->m m->i m->d i->m i->i d->m d->d b->m m->e -5 * -8214 1 -11939 -10253 -11179 -11566 -11691 -10204 -10809 -12839 -11759 -12093 5406 -11619 -10636 -11658 -11166 -12547 -12065 -12585 -10367 -11704 1 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -180 -13377 -3090 -894 -1115 -701 -1378 -5 * 2 796 -422 -672 143 -1200 408 -2290 -1388 1614 -1733 -1045 -85 -825 453 1392 -83 -1045 -1140 -1965 -2230 2 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -437 -13197 -1937 -894 -1115 -5329 -36 * * 3 -151 -1033 -2319 -1859 -2106 338 1064 -1128 -760 -128 -5242 -1988 1527 -332 1575 769 216 -653 135 -598 3 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -301 -12761 -2411 -894 -1115 -6857 -12 * * 4 556 -412 -1487 -2095 227 -671 234 -2287 587 -232 -499 -187 1170 -67 974 732 2 -833 384 -2153 4 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -227 -12460 -2784 -894 -1115 -7287 -9 * * 5 485 236 -4189 -133 -2309 -400 339 -2707 539 37 -176 -962 384 -332 1767 748 -1066 -717 791 -1955 5 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -330 -12234 -2293 -894 -1115 -7504 -8 * * 6 -7 -1057 -528 -1976 -436 532 -446 -5452 207 -106 -4475 -1097 1155 34 1294 458 733 -1006 -908 -194 6 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -470 -11905 -1847 -894 -1115 -7727 -7 * * 7 -329 209 -3441 -971 -2036 -1026 -987 -4692 623 374 1131 -3185 1386 579 858 610 1034 -1623 -4994 -364 7 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -417 -11435 -1996 -894 -1115 -7935 -6 * * 8 900 1793 -1488 -3385 -388 -515 -692 -1453 -3235 -288 -2794 -3505 1073 720 1592 850 115 -1748 -4011 51 8 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -454 -11019 -1891 -894 -1115 -8056 -5 * * 9 52 1746 -2539 -852 -4481 -109 -227 -4231 10 -1365 -3251 -851 1120 564 2180 824 -109 -3783 717 -3663 9 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -584 -10567 -1591 -894 -1115 -8147 -5 * * 10 454 493 -2078 -370 -3889 -1045 1989 -3618 -246 -792 395 -1834 1414 -1399 1841 474 656 -3204 -3801 -3137 10 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -643 -9985 -1479 -894 -1115 -8224 -5 * * 11 -287 2095 -1667 -368 -3186 -2729 -1396 -2875 210 422 -2066 -1406 480 4 2097 413 -1655 -2527 2866 -2568 11 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -226 -9345 -2799 -894 -1115 -8277 -5 * * 12 -337 1101 -1627 -1075 -2742 306 491 -2391 901 -36 -1710 1138 1282 -917 1263 -1543 -1497 -326 1868 -2291 12 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -341 -9123 -2262 -894 -1115 -8290 -5 * * 13 -1430 1635 -2838 -2254 -1458 -379 -1664 1151 232 542 -674 -2145 2079 -1807 -2140 -158 1070 -906 -1915 -1540 13 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -92 -8787 -4072 -894 -1115 -8307 -5 * * 14 -29 -2843 -1494 -930 -3333 -145 -1152 -3043 1293 -2983 -2089 -1193 2011 -706 2324 252 -1485 -2598 -3125 -2522 14 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -227 -8700 -2803 -894 -1115 -8310 -5 * * 15 -1180 -1815 -1555 -992 -1896 937 -1040 -1493 -816 733 -981 -1191 90 837 501 -1293 1298 -1305 3180 -1684 15 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -115 -8479 -3756 -894 -1115 -8318 -5 * * 16 -1022 1941 -888 630 -2753 -2003 -662 -2490 925 -194 -1544 -645 1084 1025 942 464 501 -2062 -2643 -1973 16 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1090 -8370 -924 -894 -1115 -8322 -5 * * 17 -1868 -2437 -2354 -1966 -3668 1640 -1614 -3457 -612 -3343 -2655 -1888 -2809 -1297 3506 -1947 -1986 -2963 -3120 -3009 17 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -2458 -7294 -301 -894 -1115 -7417 -8 * * 18 -1178 -1048 -2294 -2036 -42 -2259 -1391 591 -1609 2477 797 -1923 -2365 -1505 -1606 -1764 -1196 272 -1152 -732 18 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -37 -5890 -6933 -894 -1115 -6778 -13 * * 19 1438 -633 -2294 -1745 -255 -2034 -882 27 -1401 1227 341 -1500 -2135 -1183 -1426 -1136 -622 23 3450 -370 19 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -17 -6952 -7994 -894 -1115 -6367 -18 * * 20 707 -643 -3047 -2419 1601 450 -1199 1219 -2037 804 170 -1952 -2389 -1676 -1871 -1421 -744 -47 2871 -732 20 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -10 -7778 -8820 -894 -1115 -5043 -44 * * 21 1311 -1453 -3796 -3170 533 -152 -1998 27 -2799 1336 -654 -2729 997 589 -2653 -2212 -1544 974 -1910 -1564 21 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -4 -8980 -10022 -894 -1115 -4550 -63 * * 22 1457 -2124 -4641 -4005 110 -3845 -2716 448 -3601 789 1700 -3491 -426 -3224 -3401 938 -2238 1059 2404 -2240 22 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -2 -9826 -10868 -894 -1115 -3669 -118 * * 23 494 -2885 -5400 -4764 984 -276 -3476 86 -4360 1530 626 -4250 821 -559 -4161 -200 -383 1059 -67 -3001 23 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -10683 -11725 -894 -1115 -3432 -140 * * 24 510 1315 -5936 -5301 1218 -851 1127 -702 -4896 1643 895 -4786 206 -425 -4697 324 -1105 -488 1537 -3536 24 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11259 -12301 -894 -1115 -2733 -235 * * 25 1404 -982 -6489 -5853 -220 -3088 -398 -2145 -5448 1686 568 -5337 -576 -719 -5248 -492 -226 1318 2133 -4086 25 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11837 -12879 -894 -1115 -1612 -572 * * 26 1048 -129 -7164 -6528 43 -1402 -1016 -110 -6123 2058 166 -2694 -145 -1617 -5923 -476 -983 368 1501 -1344 26 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12533 -13575 -894 -1115 -1694 -534 * * 27 955 1289 -7471 -6835 325 -1713 -2338 -1871 -6430 2088 304 -6319 -789 -6053 -6230 -260 -495 624 2110 -2404 27 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12847 -13889 -894 -1115 -1300 -752 * * 28 812 893 -7705 -7068 605 -441 -2695 -134 -6663 2163 -882 -6552 -51 -1439 -6463 -1045 -1993 250 1680 -2800 28 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13085 -14127 -894 -1115 -1066 -937 * * 29 562 1207 -7848 -7212 267 -417 -5921 -230 -6807 2014 547 -3570 -770 -1231 -6607 -68 -1286 532 1794 -2414 29 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13231 -14273 -894 -1115 -1044 -958 * * 30 594 1320 -7919 -7283 30 -941 -1559 278 -6878 2139 -763 -6767 -916 -3317 -6678 -1745 -760 1004 1497 -1681 30 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13303 -14345 -894 -1115 -751 -1301 * * 31 149 618 -7963 -7327 487 -1190 -1793 227 -6922 2485 -967 -3668 -742 -3312 -6722 -1163 -2159 349 670 -2046 31 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13347 -14390 -894 -1115 -112 -3745 * * 32 226 1056 -7993 -7357 618 -1155 -1756 -110 -6951 2226 477 -6841 -753 -1931 -2281 -392 -527 364 638 -3317 32 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 33 790 1943 -7992 -4035 936 -224 -1200 -84 -6951 2042 -1303 -6840 -3026 -2767 -3703 -579 -1020 718 -1660 -5589 33 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 34 993 889 -7993 -7356 676 -639 -6066 -580 -3910 2198 -820 -6841 -1952 -1690 -3799 -612 -455 360 750 -5589 34 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 35 757 777 -7992 -7356 211 -215 -2579 -958 -6951 2010 -77 -2779 -2015 -779 -3799 -220 -259 904 632 -2253 35 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 36 1615 -8119 -11084 -10488 1463 -10805 -9480 -524 -10270 2261 -169 -10518 -9919 -9087 -9773 -10134 -8544 810 1373 -8293 36 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 37 1326 -8128 -11103 -10510 840 -10837 -9514 -30 -10297 2425 -366 -10551 -9936 -9105 -9798 -10174 -8559 745 2041 -8315 37 - -150 -490 230 41 -383 400 103 -629 208 -464 -723 273 394 46 93 367 117 -369 -286 -247 - -4211 -4876 -133 -833 -1189 -701 -1378 * * 38 -2280 2064 -2741 -2192 -3097 1010 1273 -2698 -2048 116 -2182 -1085 -3547 -1975 -365 1928 1781 -2489 -3370 -2889 41 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -2 -9873 -10915 -894 -1115 -3859 -103 * * 39 -215 3399 -4946 -1953 -2842 312 705 -779 -4010 514 -2081 -4002 -279 -3704 -718 807 1137 -1056 1691 7 42 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -10624 -11666 -894 -1115 -2996 -193 * * 40 -893 2845 -1670 -1179 -930 1296 1372 -4845 -339 -234 -3932 -3084 -954 354 -1506 1444 -129 -1365 120 -245 43 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -11392 -12434 -894 -1115 -2308 -325 * * 41 -240 2497 -911 -1135 -2102 468 713 19 -4721 81 -1500 -595 1547 -4534 -1644 881 375 -939 1656 -4434 44 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -1 -12061 -13103 -894 -1115 -1108 -899 * * 42 -1946 1134 -789 -1613 -2521 1532 1050 -3103 -1120 -1815 -1231 -1439 1571 941 284 1166 506 -2108 -1682 -3045 45 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -12817 -13860 -894 -1115 -1036 -965 * * 43 -174 1150 -1760 -510 -1098 1273 130 -1911 -2405 -11 -662 -2448 1340 792 181 380 124 -329 607 -3202 46 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13116 -14159 -894 -1115 -16 -6484 * * 44 1893 1991 -3786 -3031 -2810 162 -2393 -786 -3877 -387 -1549 -3571 -3761 -1960 -3776 930 1002 1311 -6075 -5697 47 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 45 43 -297 -718 305 -284 -626 1002 -1291 -1401 1026 -1264 -980 -1954 888 549 575 -447 -443 861 -472 48 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 0 -13377 -14420 -894 -1115 -701 -1378 * * 46 2689 1847 -3441 -2940 -3552 1592 -5364 -5728 -5199 -3141 -1279 -5518 -844 -1525 -2675 602 -602 -3304 -6429 -5950 49 - * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * - * * * * * * * * 0 //